Осада столицы ацтеков продолжалась три месяца. Кортес вел ее, имея 200 ООО индейцев-союзников, почти 900 испанцев, 80 лошадей, 16 пушек, 13 бригантин и 6000 каноэ. Он потерял 50 испанцев и несколько сот индейцев убитыми. Потери мексиканцев одними только убитыми превышали 100 000 человек, не считая тех, кто погиб от голода и болезней. Великолепная столица империи была почти полностью разрушена и совершенно разграблена. Многие ее жители были превращены в рабов с нанесением на них королевского клейма, а остальные отпущены на свободу. По случаю этой страшной победы Кортес приказал жечь на улицах уничтоженного города костры, чтобы одновременно уменьшить невыносимый запах разлагающихся тел погибших в этой чудовищной бойне. Через четыре дня генерал-капитан встретился с руководителями своих союзников, сердечно поблагодарил их за оказанную помощь, дал обещание вознаградить их за верную службу и разрешил им отправиться в свои дома. Обогащенные военной добычей и довольные победой над ненавистными правителями, индейцы разошлись по своим землям.
Испанцы, ставшие теперь хозяевами одной из самых богатых империй мира, нигде не могли обнаружить ни оставленных или потерянных ими в Мехико золота и драгоценностей, ни сказочных богатств в запасниках Монтесумы. Все это исчезло бесследно, но никто из мексиканцев не мог сообщить, где находились эти несметные богатства. Испытывая страшное разочарование таким поворотом дела, они решили выяснить места их хранения у Куаутемока и одного из его сановников путем пыток. Сановник умер под пытками, не сказав ни одного слова, а Куаутемок сказал Кортесу, что за 10 дней до его пленения он приказал все имевшиеся в городе драгоценности и золото выбросить в озера. Однако и то количество золота и ценных вещей, которые все-таки оказались в руках испанцев, было довольно большим, и оно было поделено между всеми участниками экспедиции по достигнутой договоренности, за вычетом пятой доли короля.
Разгром могущественной столицы ацтеков вызвали потрясение и ужас среди многочисленных племен их обширной империи.
Уже вскоре после этой победы он принял решение приобрести земли и порты на западном берегу Новой Испании, как стала называться завоеванная империя, чтобы вести поиски пролива из Атлантики в Южное море, а также островов и земель, в которых, по словам Монтесумы, было много золота и драгоценностей. Он даже рассчитывал организовать более выгодную доставку пряностей с Молуккских островов в Новую Испанию. С этой целью уже в 1522 и 1523 годах он направляет отряд во главе с Альварадо для завоевания прибрежного края Тутупека, где тот основывает город и готовит строительство каравелл и бригантин. В другой прибрежный район в порт Сакатула он посылает бригаду судостроителей и поручает Олиду руководить строительством каравелл, а затем провести на них исследования тех далеких земель.
Расширение территории Новой Испании Кортесом происходило на фоне то и дело поднимавшихся против владычества испанцев восстаний, которые ему приходилось подавлять силой в течение еще очень долгого времени. Не один раз завоевателю ацтеков приходилось принимать меры и для того, чтобы противостоять попыткам целого ряда соотечественников воспользоваться богатыми плодами его победы путем захвата некоторых из его земель или смещением его с поста правителя в Мехико. Но Кортес умел постоять за себя и свои интересы.
После падения Мехико вожди разных племен, населявших даже такие отдаленные от столицы области, как Гватемала, Утлатлан, Чиапас и другие, присылали Кортесу своих послов с богатыми подарками и изъявлениями готовности принять его правление Там часто происходили войны и конфликты, что побудило Кортеса направить отряд испанцев во главе с Альварадо в сопровождении индейцев. Эта экспедиция вышла из Мехико 6 декабря 1523 года и направилась на юг, держась западного побережья. После очень длительного перехода Альварадо достиг южных районов Чиапас и северо-западных земель Гватемалы, где ему пришлось потратить немало сил на подавление ряда мятежных городов, в том числе Кетцальтенанго и Утлатлана, последний из которых доставил ему очень много хлопот и неприятностей В этом богатом гористом крае испанцы обнаружили много полезных ископаемых, продуктов сельского хозяйства, замечательные лесные массивы и немало городов. Войну в Утлатлане Альварадо смог завершить лишь 1 апреля 1524 года.
Оттуда он двинулся к большому и удивительно живописному озеру Атитлан, на берегу которого располагался большой город того же названия, но он оказался покинутым. После некоторых попыток Альварадо смог найти его вождей, а затем и убедить их принять его покровительство. Но в Нанситлане местное население оказало ему серьезное сопротивление, нанеся целый ряд потерь и даже ранение самому командиру. Не добившись в этом месте успеха и понеся новые потери, включая 11 лошадей, он вернулся в Гватемалу.
Эта длительная кампания Альварадо охватывала огромное расстояние в 400 лиг и была связана с голодом, лишениями, тропической жарой и трудными переходами через реки и болота. Она не дала ему какой-либо существенной добычи, кроме рабов, но привела к умиротворению большинства провинций. Эти покрытые обширными лесами и живописными горами земли — на языке местных индейцев слово «Гватемала» означает «лесистая земля» — настолько понравились Альварадо, что он решил не только основать здесь колонию по инструкциям Кортеса, но и остаться ее руководителем Он основал там город Сантьяго-де-Гватемала, заложил собор, создал городской совет, начал раздавать земли и индейцев колонистам, а затем написал Кортесу свой отчет обо всей экспедиции и о своих планах. Кортес одобрил планы своего подчиненного, направил к нему еще отряд испанцев и поддержал его ходатайство о назначении губернатором покоренной им страны. В результате проведенной по приказу Кортеса этой многомесячной экспедиции Педро де Альварадо стал первооткрывателем и конкистадором новых земель в центральной части Американского континента.
К этим открытиям и завоеваниям вскоре прибавились и другие, совершенные тоже по инициативе Кортеса еще одним его военачальником, Кристобалем Олидом, в том же южном направлении от Мексики. Кортес, слышавший немало сообщений о богатых золотом и плодородными землями краях несколько южнее Гватемалы, хотел направиться туда сам, тем более что к этому времени он получил приказ короля Испании от 6 июня 1523 года провести обследование восточного и западного берегов континента с целью нахождения пролива между Атлантикой и Южным морем, который был так нужен кастильцам для выхода к островам Пряностей. Но в этот период Кортес был очень занят противодействием новым проискам Франсиско Гарая в районе реки Пануко в Мексиканском заливе, и поэтому решил поручить данную миссию Олиду. Параллельно с этим он послал в поисках пролива две каравеллы вдоль Мексиканского залива на северо-восток в сторону будущего Техаса и приступил к подготовке такой же экспедиции на западном побережье в направлении Панамы.
