15 октября 1920 года, когда последний японский эшелон покинул Забайкалье, войскам Амурского фронта ДРВ был отдан приказ о наступлении, совместно с так называемыми «народоармейцами», названными большевиками для простоты наименования «повстанческой армией».
Наступление на первых порах явилось совершенной неожиданностью, но уже спустя два дня, 20 октября 1920 года, каппелевскими частями был нанесен ощутимый контрудар красным отрядам на центральном участке наступления и к северу от Читы. Против каппелевцев действовали многочисленные партизанские отряды, собранные для этого по всему Дальнему Востоку и превосходно вооруженные. Они наносили неожиданные удары, сбивали боевые порядки каппелевцев, оставляя регулярным красноармейским подразделениям довершать свое дело, опрокидывая белые войска. Целью большевистских ударов было отрезать семеновские части как можно быстрее от границы и не дать им уйти в Манчжурию, затем окружить и уничтожить. Под непрерывными ударами противника отошел из Читы корпус генерал-майора Викторина Михайловича Молчанова, пробиваясь на юг, но в целом каппелевские части успели нанести несколько увесистых контрударов большевикам под Храшаибири, Хадабулаком и под Борзей. Под непрерывными атаками красных 1-й семеновский корпус разделился на несколько отрядов и частей, самостоятельно уходивших к китайской границе. Несколько подразделений 1-го семеновского корпуса отражали наступление красного 1-го Забайкальского корпуса у станций Борзя и Оловянная. С востока и запада каппелевские и семеновские части сходились у Манчжурской дороги, постепенно переходя в организованное наступление вдоль нее. У большевиков никак не получалось окружить белые части. Не могли они и препятствовать белому отходу за китайскую границу. К 21 ноября 1920 года оба каппелевских и семеновский корпуса благополучно пересекли манчжурскую границу, где были остановлены китайскими регулярными войсками, разоружены и переведены на положение «беженцев», расположившихся в Харбине и в полосе КВЖД. Атаман Семенов направился в Приморье, где еще сохранялось влияние японцев и существовало коалиционное правительство, пытаясь отстаивать идеи Белого движения, но по настоянию Владивостокского правительства был выслан в Китай и отправился в Порт-Артур в декабре 1920 года. Часть перешедшего русско-китайскую границу 1-го семеновского корпуса оказалась впоследствии рассеянной по монгольским, бурятским и тувинским улусам, самообразовавшись в повстанческие партизанские отряды под предводительством легендарного барона Романа Унгерн фон Штернберга и менее известных Бакича, Кайгородова и Казанцева. Еще одна часть бывшего корпуса, оставшись в Советской России, перешла на службу в Красную армию или подалась в «народные партизанские отряды», участвовавшие впоследствии в красном терроре против «тайных белогвардейцев» и «семеновских шпионов».
После военной победы над атаманом Семеновым установившаяся безраздельная советская власть вновь ознаменовалась волнами террора против населения в городах и казачьих станицах. На фоне террора в Дальневосточной республике прошли выборы в Учредительное собрание, начавшее свою работу в феврале 1921 года. Подавляющее большинство мест в Учредительном собрании досталось крестьянам, поддерживающим коммунистов, за ними вторыми по численности шли большевики, чуть меньше — эсеры и незначительные в процентном отношении места достались представителям других партий и направлений, в частности, наиболее популярным генералам колчаковской армии Молчанову и Григорию Афанасьевичу Вержбицкому, не захотевшим приезжать ради такого случая из Китая в Читу. Работа Учредительного собрания затянулась до апреля 1921 года. За два месяца работы Собрания была принята «демократическая» конституция, определилась территория, называемая Дальневосточной республикой, занимавшая теперь все пространство от Байкала до Владивостока, а под конец и само Учредительное собрание было переименовано в Народное.
К маю 1921 года было образовано коалиционное правительство, призванное продемонстрировать Японии и странам Запада классический «парламентаризм». Новое правительство состояло из представителей разных партий и объединений, но находилось под полным и безраздельным большевистским контролем. Вместе с работой парламентских групп развязанный большевистскими силами в Забайкалье террор против казаков не только не закончился, но и набирал новые обороты. Забайкальские казаки начали уходить в ближайшие страны — Монголию и Китай, где за некоторую плату вечно коррумпированным китайским чиновникам, им позволялось перегонять скот и строить зимовники. За несколько месяцев, начиная с зимы 1921-го по весну того же года в Китай перебралась почти десятая часть всего Забайкальского казачества. Сравнительно прозрачные границы и легкость их пересечения в двух направлениях позволили большевикам совершить несколько карательных рейдов, направленных против казаков, когда отряды большевистского партизана Федорова совершили налет на казачьи заимки на китайской стороне, угнали скот и разграбили нескольких зажиточных казаков, а самих подвергли аресту. Чуть позже славный красный партизан Федоров осознал, что прав на арест казаков, проживающих на китайской территории, у него нет, а поэтому часть казаков была отпущена, а другая в спешке расстреляна. После чего красный партизанский отряд удалился домой, уводя за собой богатые трофеи, собранные в казачьих поселениях. Несмотря на очевидную нелегальность и жестокость подобных действий, сам инцидент, похоже, мало кого удивил. А самих казаков даже не подвиг на вооруженный отпор распоясавшимся большевикам. Казаки продолжали свое бытование на чужой стороне, надеясь, что в следующий раз Бог милует.
Как ни странно, именно тогда, в 1921 году, в ходе Гражданской войны, по-видимому, произошел некий надлом, свидетельствующий об изменении ее природы, — превращении ее из классической войны, с наступательными операциями и атаками под оркестр, каковыми ее делали Туркул и Дроздовский, планировали и осуществляли Деникин и Врангель, в войну почти партизанскую, с дикими набегами сторон друг на друга, переменным выхватыванием власти над населенными пунктами и областями и пирровыми победами, ничего, по сути, не меняющими.
В ней, этой новой войне, где по привычке фигурировали две противостоящие стороны — большевики и их противники, постепенно растворялась и сама Белая идея с ее принципами единой и неделимой России, отказом от территориальных уступок иностранцам, и главное, теперь эти тлеющие очаги сопротивления большевизму едва ли уже могли справиться с задачей возрождения России в целом. Это было еще долгое, но уже искаженное эхо противостояния повсеместно утвердившемуся злу.
…12 мая 1921 года было завершено формирование правительства Дальневосточной республики, а через две недели его потряс новый переворот, в результате которого вся полнота власти перешла к дальневосточным промышленникам братьям Меркуловым. Братья стали во главе Временного Приамурского правительства, в котором уже отсутствовали представители большевиков. Правительство было поддержано японцами. Для защиты собственной территории от захвата большевиками и гарантии своего более или менее стабильного существования правительство озаботилось вопросами создания боеспособной армии. Меркуловы повели переговоры с осевшими у КВЖД и в Харбине каппелевскими частями и их руководителями — 29-летним генералом Анатолием Николаевичем Пепеляевым и 35-летним генерал-майором Викторином Михайловичем Молчановым. Каппелевцы согласились вернуться в Приморье, а над свежесформированными их частями, насчитывающими 15 тыс. бойцов, был утвержден генерал-лейтенант Михаил Константинович Дитерихс. Следом за регулярными частями в Приморье из Китая вернулась часть Забайкальских казаков. Из них было создано вспомогательное казачье соединение под командованием генерала Глебова.
28 августа 1921 года в Дальяне была созвана конференция, имевшая своей целью обсуждение и урегулирование отношений на Дальнем Востоке Японии и Дальневосточной республики и о выводе японских оккупационных войск с российской территории. Контроль над оккупированной территорией становился все более тягостным для японских войск. Гарнизоны оккупантов сосредотачивались на крупных железнодорожных станциях, а прилегающие к ним территории оставались во власти местных партизанских отрядов, досаждающих японским гарнизонам постоянными нападениями и мелкими стычками. Организация карательных экспедиций, равно как и ведение полномасштабных, боевых действий, Японией исключались по двум причинам: практическая неуязвимость мелких отрядов, при необходимости растворявшихся в дальневосточных дебрях, и отсутствие уверенности, что другие державы мира поддержат начало боевых действий. Правительство Японии сочло за благо оставить Приамурье и отойти в Приморье, где у власти были братья Меркуловы, но главное, что стратегически Приморье было легче удержать в случае наступательных операций с запада и столь же легко организовать эвакуацию основных сил. Отход японских оккупационных войск сопровождал накат партизанских соединений Дальневосточной республики. Оставленный японскими частями Хабаровск был сразу же «взят» партизанами и поставлен под свой контроль. Путь партизан теперь лежал в Приморье, откуда навстречу им выдвинулись части под командованием генерала Дитерихса, не только отбившие первую волну партизанского натиска, но и перешедшие 30 ноября 1921 года в контрнаступление. В ходе него части Дитерихса, разгромив и разметав остатки дальневосточных партизанских отрядов по окрестностям, обрушившись на «регулярную» народную армию, шедшую за партизанами, вытеснили ее за Амур. После того прочно утвердились на позициях на северном берегу реки. Видя, что противник отступает, Дитерихс приказал организовать его преследование вдоль Транссибирской железной дороги. Одновременно с наступлением на западном направлении большевикам был нанесен удар и на севере. Дитерихс командировал отряд есаула Бочкарева с отрядом забайкальских казаков для занятия Петропавловска-Камчатского, что тот с успехом и сделал. Одновременно с этим поднялось восстание в Якутии против большевистского ига и произвола ЧК, проводившей расстрелы и экспроприации собственности «якутских богатеев». Восстание было возглавлено корнетом Владимиром Коробейниковым и учителем словесности Михаилом Артемовым. Организовав из якутских охотников небольшие партизанские отряды, они очистили от советской власти всю обитаемую часть Якутии и удерживали ее на протяжении зимы 1921–1922 годов. Для уничтожения вспыхнувших очагов восстания большевики сосредоточили многотысячную военную группировку под командованием В. К. Блюхера. 5 февраля 1922 года группировка была брошена в наступление, постепенно тесня численностью уступающие ей белые соединения и части и выйдя к 10 февраля 1922 к основному белому рубежу обороны — станции Волочаевка. Руководство обороной было сосредоточено в руках генерала Молчанова. Войска Блюхера предпринимали неоднократный штурм укрепленного района, но каждый раз стойко отбивались его защитниками. В ходе боев, потеряв большое количество оборонявшихся, укрепленный район был захвачен подведенными свежими силами большевиков, вынудив части Молчанова покинуть Волочаевку и отступить на восток. 14 февраля 1922 года большевики вошли в Харбин. Теперь большевистское командование на Дальнем Востоке могло переключить свои ударные силы на подавление восстания в Якутии, для чего командующий 5-й советской армией Уборевич откомандировал туда Гонготскую кавалерийскую дивизию под командованием Каландаришвили. Дивизия выдвинулась в Якутск, ожидая легкой победы над полярными охотниками, но неожиданно для себя попала в засаду в 30 верстах не доезжая Якутска и полностью погибла. Дивизия во главе со своим грузинским командиром, уверенным, что, не встречая сопротивления, по мере продвижения к городу, он заранее навел ужас на недалеких якутов с охотничьими ружьями, была уничтожена неожиданным ударом повстанцем.