Станция «Кропоткинская» до настоящего времени считается классической в истории советского метростроения благодаря простоте архитектурных форм и лаконизму общего замысла. За проектирование и строительство станции «Кропоткинская» А. Н. Душкин получил в 1941 г. Государственную премию СССР.
В 1937 г. сооружена станция метро «Площадь Революции». Автор стремился в интерьере подземного зала зрительно облегчить тяжесть пилонов. Это с успехом достигнуто устройством над проходами архивольтов[1 Архивольт — обрамление арочного проема, выделяющее дугу арки из плоскости стены.] захватывающих окончанием своих дуг части пилонов, и заполнением глухих стен почти круглой скульптурой, выполненной скульптором М. Г. Манизером.
Наружный вестибюль станции «Площадь Революции» (1938 г.) с основной частью — эскалаторным залом, сооруженный рядом с Центральным музеем В. И. Ленина, спроектирован Душкиным как скромный вестибюль, ведущий к площади, и, в отличие от интерьера станции, решен спокойно и просто.
В это же время Алексей Николаевич спроектировал и построил в Москве 13 общеобразовательных школ (на 800 учащихся каждая).
В получившей широкую известность станции «Маяковская» (1938 г.) впервые в станции глубокого заложения бетон внутренних опор был заменен металлом и таким образом тяжелые пилоны превратились в изящные колонны. Два ряда колонн поддерживают три продольных свода овального сечения и завершаются овальными же арками; каждое звено центрального свода завершается поперечным куполом, трактованным как источник освещения зала. Новым в этой станции явилось использование нержавеющей стали в качестве декоративного материала, а также применение в куполах мозаики из смальты на тему «Авиация» (художник А. А. Дейнека). Нельзя признать удачным включение в композицию куполов мозаики. Глубина двойного купола скрывает живопись, лишает нас возможности видеть ее под разнообразными углами, ряд плафонов пе воспринимается одновременно. Несмотря на это, станция «Маяковская» может служить примером новаторского решения архитектурных задач.
Следующей станцией метро явилась станция «Автозаводская» с вестибюлем (1940—1943 гг.), за которую автор получил Государственную премию СССР 1946 г. Колонны и стены подземного зала облицованы светлым мрамором и украшены мозаичными панно на тему труда и обороны.
В послевоенные годы Алексей Николаевич совместно с архитектором Б. Д. Хилькевичем спроектировал в Сталинграде вокзал (1944 г.) и совместно с архитекторами Н. Д. Панченко и Б. Д. Хилькевичем Пантеон героям Отечественной войны, по его проектам было осуществлено строительство железнодорожных вокзалов в городах Симферополе (соавтор Г. Г. Аквилев, при участии архитектора И. М. Потрубач, 1949 г.), Днепропетровске (соавтор архитектор И. М. Потрубач, 1950 г.), Сочи (соавтор архитектор Г. Г. Аквилев, 1951 г.).
С конца 1930-х и до 1960-х гг. Алексей Николаевич занимал ряд ответственных постов: он был начальником архитектурного отдела Метропроекта, главным архитектором Центральной архитектурной мастерской МПС, главным архитектором Мосгипротранса, главным архитектором Метрогипротранса Министерства транспортного строительства.
В 1951 г. по проекту А. Н. Душкина совместно с архитектором А. Ф. Стрелковым построена станция Кольцевой линии третьей очереди метрополитена «Новослободская». Основной замысел авторов в композиции перронного зала состоит в применении цветных, подсвеченных изнутри витражей на пилонах. Этот прием впервые встречается в оформлении станций; интересный сам по себе как декоративное средство, в данном случае он конструктивно не оправдан. Архитекторы перенасытили станцию декоративными мотивами.
В 1951 г. по проекту А. Н. Душкина совместно с архитектором Б. С. Мезенцевым построен высотный дом на Лермонтовской площади.
Высотное здание Министерства транспортного строительства СССР на Лермонтовской площади расположено на пересечении Садового кольца с Каланчевской улицей. Здание представляет собой сложный комплекс административных и жилых корпусов, архитектурно решенных как единый объем, имеющий в плане форму незамкнутого прямоугольника.
Центральная часть здания занята управлениями министерства, боковые корпуса — жилые. Административная часть здания в виде центральной башпи имеет 16 рабочих этажей и достигает высоты около 110 м. С обепх сторон ее — торцевые башни.
Башенная часть здания состоит из трех гармонично убывающих по высоте н сечению объемов. С каждым уступом архитектурные членения становятся все тоньше, а рельеф сложнее и богаче. Башенное завершение имеет наибольшую пластическую насыщенность и завершается шпилем с пятиконечной звездой. Нижняя часть оформлена торжественным трехпролетным порталом входа, а верхняя — рельефным изображением государственного герба.
В административном корпусе размещаются 300 рабочих комнат, зал для собраний на 300 человек, семь залов заседаний, выставочный зал, столовая и другие служебные помещения.
Жилые корпуса состоят из 276 двух-, трех- и четырехкомнатных квартир. Каждая квартира имеет выход на две лестницы. В первом этаже корпуса, выходящего на Каланчевскую улицу, помещается вестибюль станции метрополитена и магазины. В нижних этажах противоположного корпуса — детские ясли, прачечная и другие служебные помещения. Фасады жилых объемов обогащены системой эркеров, а нижний этаж обработан лопатками с глубоким рельефом.
Понижение рельефа к северной границе участка использовано для устройства подземного хозяйственного двора. Общий объем комплекса — 275 тыс. м³.
В целом авторы создали убедительный образ государственного здания в формах, развивающих лучшие традиции русского зодчества.
Немалый труд вложен в соавторстве с архитекторами Г. Г. Аквилевым, Ю. В. Вдовиным, И. М. Потрубач в строительстве здания универмага «Детский мир» в Москве на площади Дзержинского (просп. Маркса, 2, 1955 г.).
Площадь торговых помещений «Детского мира» — 69 200 м², торговых мест — 167, строительный объем — около 300 тыс. м³. В первом — четвертом этажах — торговые залы; в пятом, седьмом и подвальном — административно-хозяйственные и складские помещения. Здание снабжено 14 эскалаторами и 5 парадными лестницами.
В композиции фасадов этого здания, играющего немаловажную роль в формировании площади, есть разномасштабность, сказывающаяся в несоразмерности гигантских арочных витрин и окон шестого-седьмого этажей. Архитектурно-планировочное решение универмага не совсем удачно. Сложная неправильная конфигурация плана обусловила наличие ряда неудобных помещений.
В 1958 г. А. Н. Душкин совместно с архитекторами Ю. В. Вдовиным и Б. И. Тхором участвовал в конкурсном соревновании на проект Дворца Советов на Ленинских горах. Их проект под девизом «Вся власть Советам» был удостоен поощрительной премии.
Будучи всесторонне одаренным архитектором и столько же художником, живописцем, рисовальщиком, А. Н. Душкин хорошо чувствовал художественную форму и владел ею, в том числе и скульптурную. Не случайно поэтому в его творчестве большое место занимает совместная работа со скульпторами над созданием ряда монументов и памятников. В разные годы он работал над ленинской темой. По его проектам осуществлены монументы В. И. Ленину во Владимире (совместно со скульптором Д. Б. Рябичевым, 1958 г.), в Саранске (совместно со скульптором Н. В. Томским, 1960 г.), в Александрове (совместно со скульптором Г. В. Неродой, 1967 г.). В содружестве с Неродой им осуществлен в 1971 г. монумент В. И. Ленину с планировкой площади в Улан-Удэ. Большой творческой удачей Душкина и скульптора Н. А. Щербакова является памятник В. И. Ленину в Барвихе под Москвой (1970 г.).
Новую страницу в творчестве Душкина открывают монументы воинам, павшим в Великую Отечественную войну; монументы Победы в Саранске, защитникам Заполярья в Североморске (1973 г.), монумент Победы в Новгороде — 1974 г. (совместно со скульптором А. Н. Филипповой) и, наконец, значительный монумент-ансамбль в честь 850-летия Владимира (совместно со скульптором Д. Б. Рябичевым, 1960 г.). В 1970-х гг. Алексей Николаевич проектирует совместно со скульпторами несколько мемориальных досок, установленных в Москве. Это — мемориальная доска академику П. П. Ширшову (скульптор Ю. Ф. Иванов), художнику А. И. Лактионову (скульптор А. Н. Филиппова), а также эскизный проект монумента Ю. А. Гагарину, надгробие Л. А. Фотиевой на Новодевичьем кладбище (скульптор Г. М. Огнев), С. М. Эйзенштейну (скульптор Г. В. Нерода).
Большой мастер советской архитектуры, Алексей Николаевич в продолжение всей своей жизни активно участвовал в деятельности Союза архитекторов, был членом правления СА СССР. А. Н. Душник вел большую общественную работу. С 1947 по 1953 г. он — депутат Московского городского Совета.
Немалую роль в его творческой биографии играет и преподавательская деятельность. С 1966 по 1974 г. Алексей Николаевич профессор Московского архитектурного института; в целом, включая работу по совместительству, А. Н. Душкин преподавал в этом институте более 25 лет (с 1947 г.).