Основной целью десантов этого периода являлось воспрещение отхода войск противника и содействие сухопутным войскам советских фронтов в окружении и разгроме его группировок на приморских направлениях. Значительная часть десантов в это время высаживалась непосредственно в морские порты противника с целью воспрещения его эвакуации морским путем.
К этому времени Военно-Морской Флот уже имел хорошо подготовленные к действиям в составе десантов соединения и части морской пехоты. Поэтому, даже несмотря на сжатые сроки подготовки, десанты, как правило, успешно решали поставленные задачи.
На Балтийском театре военных действий в начальный период войны систематически высаживаемые на финские острова десанты военно-морской базы Ханко значительно расширили операционную базу, заставив противника держать в районе полуострова большое количество войск и боевой техники. Тем самым гарнизон Ханко оказал существенную помощь войскам 23-й армии, защищавшей подступы к Ленинграду с северного направления.
Высадкой нескольких десантов в районе Стрельна — Петергоф была создана реальная угроза приморской группировке противника в этом районе путем овладения участком побережья атакой войск 42-й армии с фронта и высадкой десантов в тыл немецких войск. Поэтому для противодесантной обороны побережья противник был вынужден привлечь значительное количество сил и средств.
Успех войск 55-й армии Ленинградского фронта в августе 1942 г. по ликвидации Усть-Тосненского узла сопротивления противника в значительной степени был обеспечен активными и решительными действиями десанта, высаженного 19 августа 1942 г. Ленинградской военно-морской базой в районе Ивановки. Захватив мосты и дороги, десант воспретил подход к Усть-Тосненскому узлу сопротивления немцев резервов и частей с других участков фронта и тем самым способствовал его разгрому войсками 55-й армии.
В завершающем периоде Великой Отечественной войны Балтийский флот высадкой десантов на острова Выборгского залива и Моонзундского архипелага в 1944 г. и на косу Фрише-Нерунг в 1945 г. значительно расширил свою операционную зону и оказал существенную помощь сухопутным войскам на приморском направлении в ходе Прибалтийской стратегической наступательной операции.
Высадкой десантов на острова Лункулансаари и Мантсинсари (21–26 июля 1941 г.) Ладожская военная флотилия создала для противника реальную угрозу нарушения его прибрежных коммуникаций, воспрещения подхода резервов и нанесения ударов в тыл его группировки, наступавшей вдоль восточного побережья Ладожского озера. Вследствие этого противник был вынужден ослабить свою ударную группировку, выделив для борьбы с десантами до полка пехоты, четыре батареи и до роты танкеток и бронемашин.
Таким образом, учитывая сравнительно небольшой состав приозерной группировки финских войск, десанты отвлекли значительную часть сил противника и оказали тем самым существенную помощь войскам 7-й армии, оборонявшим восточное побережье Ладожского озера.
Тактические десанты в районе Шлиссельбурга (9–29 сентября 1941 г.) отвлекли часть сил и средств противника на побережье Ладожского озера и таким образом способствовали проведению наступательных операций войск Волховского фронта с целью уничтожения шлиссельбургской группировки немцев.
Высадкой оперативного десанта морской пехоты в район устья реки Тулоксы (22–27 июня 1944 г.) была создана реальная угроза окружения отступавших вдоль побережья частей финской олонецкой группировки, что заставило противника выделить для борьбы с десантом часть своих сил из состава действовавших против 7-й армии войск.
На Черноморском театре военных действий успешное проведение контрнаступления войск Одесского оборонительного района с целью уничтожения приморской группировки противника и его дальнобойной артиллерии, обстреливавшей город, в значительной степени было обусловлено активными и решительными действиями морского и воздушного десантов морской пехоты Черноморского флота, высаженных 22 сентября 1941 г.
В результате высадки оперативно-стратегического десанта на Керченский полуостров и в Феодосию (26–31 декабря 1941 г.), когда был образован Крымский фронт, противник был вынужден оставить полуостров и привлечь для борьбы с высаженными войсками значительные силы из-под Севастополя и с таганрогского направления, что значительно облегчило положение войск, прежде всего Севастопольского оборонительного района. Кроме того, был захвачен плацдарм для развития наступательной операции с целью освобождения Крымского полуострова и на время устранена угроза прорыва противника на Кавказ через Таманский полуостров. Высадкой Черноморским флотом десанта в районе Станички в феврале 1943 г. были созданы благоприятные условия для проведения Новороссийской десантной операции, завершившейся освобождением второй по значимости военно-морской базы Черноморского флота и разгромом мощного оборонительного района противника на Таманском полуострове.
Высадкой десантов в районах Анапы, Благовещенской и Соленого озера (сентябрь 1943 г.) Черноморский флот и его морская пехота оказали существенную помощь войскам Северо-Кавказского фронта в ходе Новороссийско-Таманской наступательной операции.
Высадкой десантов осенью 1944 г. на побережье и в порты Румынии и Болгарии в ходе Ясско-Кишиневской наступательной операции Черноморский флот оказал значительную помощь войскам Красной Армии в овладении рядом важных опорных пунктов и военно-морских баз противника. Для форсирования Днестровского лимана была проведена десантная операция с высадкой оперативного десанта, основную часть которого составили 83-я ОБРМП, 255-я ОМСБР Черноморского флота и 369-й отдельный батальон морской пехоты Дунайской военной флотилии.
Десанты Азовской военной флотилии, высаженные в летней кампании 1943 г. на северном побережье Азовского моря западнее Таганрога и Мариуполя и в районе Темрюка, вызвали панику в тылу противника, нарушили его прибрежные коммуникации и тем самым способствовали прорыву немецкой обороны частями Южного и Северо-Кавказского фронтов и освобождению от противника северного побережья Азовского моря и Таманского полуострова.
Частями 56-й армии, высаженными Азовской флотилией в ноябре 1943 г. севернее Керчи, был захвачен плацдарм на Керченском полуострове, что создало благоприятные условия для развития наступления войск отдельной Приморской армии с целью уничтожения крымской группировки противника.
Последующая высадка десанта в районе мыса Тархан на северное побережье Керченского полуострова и непосредственно в Керченский порт (10–23 января 1944 г.) способствовала успеху наступления ранее высаженных соединений и частей 56-й армии.
Содействуя наступлению войск 2-го и 3-го Украинских фронтов вдоль реки Дунай, Краснознаменная Дунайская флотилия в 1944–1945 гг. осуществила высадку 13 десантов, значительно облегчив соединениям и частям фронта овладение рядом опорных пунктов противника и занятых им городов на берегу реки.
На реке Припять Краснознаменная Днепровская флотилия высадила семь десантов, способствовавших войскам 1-го Белорусского фронта в овладении многими важными городами и населенными пунктами, такими как Здудичи, Петриков, Борки, Почапцев, Пенковичи, Пинск и др.
На Дальневосточном театре военных действий высадкой ряда десантов морской пехоты и сухопутных войск в августе 1945 г. в порты Северной Кореи, на остров Сахалин и Курильские острова Тихоокеанский флот оказал существенную помощь советским войскам в разгроме японской армии, как на материке, так и на островах.
Десантами морской пехоты и сухопутных войск были заняты важные порты Юки, Расин, Сейсин на побережье Кореи; Торо, Эсутору и Макао на Сахалине и ряд островов Курильской гряды.
Таким образом, десанты, высаженные советскими флотами и флотилиями в годы Великой Отечественной войны, оказали существенное влияние на ход боевых действий на приморских направлениях как в оборонительных, так и в наступательных операциях сухопутных войск. В то же время при проведении десантных операций и высадок морских десантов во время Великой Отечественной войны имелся ряд существенных недостатков.
Так, руководство десантной операцией (высадкой десанта), от действий которого зависел в целом успех, в большинстве случаев оставляло желать лучшего. Операцией руководили, как правило, несколько человек: в период ее подготовки, посадки десанта на корабли, перехода морем и во время боя за высадку эту функцию выполнял морской начальник (обычно командир базы или командующий флотом), а с момента высадки десанта на берег — армейский командир (как правило — командующий армией). Фактически же, в большинстве случаев при действиях на берегу десант был предоставлен сам себе. Оба командующих не подчинялись друг другу, что требовало вмешательство в руководство операцией со стороны командующего фронтом.