Подполковник Б. Карагодин, командовавший в Афганистане мотострелковым полком, утверждает, что «командиры всех степеней всегда дорожили молодежью и необстрелянных в бой не пускали». По прибытии в часть новобранцы сводились в специальное подразделение и проходили курс обучения под опекой специалистов, имевших опыт боев в горно-пустынной местности. Если не было возможности организовывать подготовку в масштабе части, то новички ее проходили в подразделениях, где к ним также прикреплялись солдаты и сержанты, имевшие боевой опыт. Такая подготовка обеспечивала планомерное вхождение в строй молодого пополнения и сокращала потери личного состава на поле боя.
Таким образом, при ведении боевых действий ограниченным контингентом советских войск в Афганистане существовала четкая система подготовки командного состава и войск, которая постоянно совершенствовалась. Основным направлением этого процесса следует считать максимальное приближение всех отрабатываемых учебных задач к реальным условиям боевой обстановки. В то же время постоянная высокая «текучесть» кадров и отсутствие заранее разработанных и апробированных боевым опытом руководств и методик отрицательно влияли на эффективность учебного процесса.
При решении различных оперативных и боевых задач войска 40-й армии тесно взаимодействовали с вооруженными силами Афганистана, которые состояли из сухопутных войск, военно-воздушных сил, противовоздушной обороны и пограничных войск. Кроме того, в их состав на правах видов вооруженных сил входили территориальные войска и формирования гражданской обороны, а также специальные войска, тыл армии и военно-учебные заведения. Общая численность вооруженных сил в разное время колебались от 120 до 150 тыс. человек.
Боевой состав афганской армии был представлен четырьмя армейскими корпусами, тринадцатью пехотными дивизиями, двадцатью двумя бригадами (три танковые, одна мотопехотная, одиннадцать пограничных, одна артиллерийская, одна противовоздушной обороны, две тыла армии, две специального назначения «Командос» и одна бригада «Гвардия»). Кроме того, было около сорока отдельных полков, которые входили во все виды и рода войск, но большая их часть относилась к территориальным войскам. Эти части были различного назначения и подчинения (центрального, министерства обороны, корпусного и др.). Кроме того, в вооруженных силах насчитывалось более тридцати отдельных батальонов, дивизионов, эскадрилий и видов войск, специальных войск и тыла армии, находящихся как в центральном, так и в корпусном подчинении.
Большое количество различных по организации войск отрицательно сказывалось на общем уровне боевой готовности вооруженных сил. Поэтому в 1980-х годах командование армии постоянно проводило мероприятия с целью повышения боеспособности своих частей и подразделений. В середине 1980-х годов часть отдельных батальонов была преобразована в полки, все дивизии были приведены к единой структуре. Ряд боевых подразделений армии были освобождены от охранных функций. Это позволило привлечь большее количество войск для ведения боевых действий и улучшило управление частями и соединениями.
Афганская армия была оснащена вооружением и боевой техникой в основном советского производства. Всего для выполнения различных оперативно-боевых задач она имела около 800 танков различного типа, 130 боевых машин пехоты, свыше 1220 бронетранспортеров и боевых разведывательных машин, более 2600 орудий полевой, реактивной артиллерии и минометов, 300 самолетов и вертолетов различного типа и предназначения, а также 13 тыс. автомобилей. Данной материальной базы было достаточно для проведения не только боев, но и операций армейского масштаба.
В то же время афганское командование испытывало ряд проблем при использовании вооружения и боевой техники. К таким проблемам в первую очередь относились сложности их восстановления ремонтными органами. Объяснялось это слабой ремонтной базой и недостатком специалистов высокой квалификации. Другой проблемой была слабая подготовка младших специалистов и неукомплектованность экипажей танков и боевых машин. Все это вело к неправильной эксплуатации вооружения и техники, к их преждевременному выходу из строя.
Подготовка офицерских кадров для афганской армии осуществлялась в основном в трех военных училищах. Одно из них готовило общевойсковых командиров, второе — офицеров ВВС и войск ПВО, третье — технических специалистов. Кроме того, в Афганистане функционировали высшие офицерские курсы, занимавшиеся повышением подготовки офицеров с учетом поступления новых средств вооруженной борьбы и развития военного искусства. В стране также существовал военный лицей, где обучение велось по типу советских суворовских военных училищ. Часть офицерского состава проходила подготовку в советских военно-учебных заведениях.
Уровень подготовки военных специалистов в афганских военно-учебных заведениях в первые годы войны не соответствовал требованиям времени. Поэтому военно-политическое руководство страны в середине 1980-х годов осуществило ряд мероприятий с целью устранения этого недостатка. Были увеличены сроки обучения: на высших офицерских курсах с трех до шести месяцев, в военных училищах (кроме общевойскового) с 21 месяца до 3 лет. Впервые была проведена аттестация офицеров и генералов преподавательского состава в военно-учебных заведениях. Налажена подготовка офицеров запаса на четырех кафедрах гражданских вузов Кабула (в университете, политехническом, медицинском и педагогическом институтах). Ею было охвачено более трех тысяч студентов.
Совершенствование уровня профессиональной подготовки командного состава афганской армии осуществлялось на командирских занятиях, которые проводились регулярно по два дня в месяц, на командирских сборах, проводимых раз в период обучения, а также в ходе недельной программы подготовки к боевым действиям. Основные усилия сосредотачивались на обучении командиров и штабов организации боевых действий и руководству войсками в ходе их проведения.
В последующем такая система подготовки в основном обеспечивала потребность афганской армии квалифицированными офицерскими кадрами. Вместе с тем в самой кадровой работе допускалось немало упущений. Имели место случаи назначения на должности и присвоения воинских званий в зависимости от принадлежности к различным крыльям партий или на основе приятельских и семейных отношений. Не был налажен жесткий контроль за расстановкой офицеров и специалистов, окончивших высшие военно-учебные заведения, непосредственно на местах. Некоторые офицеры необоснованно отстранялись от руководящих постов и должностей и перемещались на менее важные участки работы. Другие получали ответственные посты без опыта работы в данной военной специальности.
Еще хуже было состояние рядового и сержантского состава, который комплектовался призывниками на основании принятого правительством страны закона о всеобщей воинской обязанности всего мужского населения. С целью его реализации в стране было создано 46 военных комиссариатов, из которых 12 находились в Кабуле, 5 — в уездах и 29 — в провинциях.
В сложившейся обстановке они были не в состоянии выполнить в полном объеме возложенные на них задачи и занимались в основном проведением призыва, постановкой на военный учет военнообязанных и оформлением отсрочек. В целом силами военкоматов призывалось до 65 % воинского контингента.
Кроме военкоматов, вопросами призыва занимались непосредственно сами войска, для чего в управлениях соединений и отдельных частей существовали специальные отделения. Сферой их деятельности были отдельные сельские районы и территории, находившиеся под контролем оппозиции. В этих целях планировались и проводились совместные специальные операции. Неудивительно, что при таком подходе преобладающим был принудительный призыв, который обеспечивал более 70 % рядового состава армии. Остальные были добровольцами. После подготовки они, как правило, направлялись на должности младших командиров или военных специалистов. Для обучения младших командиров или военных специалистов существовали учебные полки и школы, готовившие связистов, сержантов-пограничников, специалистов тыла, механиков-водителей боевых машин и т. д. Подготовка остального молодого пополнения организовывалась в учебных батальонах дивизии и учебных ротах бригад, а также в учебных центрах сухопутных войск. 15 последних готовили сержантов и войсковых специалистов. Продолжительность обучения молодых солдат составляла один месяц: сержантов и специалистов готовили 3–4 месяца.
Боевая подготовка в афганской армии планировалась на учебный год с учетом полученного войсками боевого опыта. Части и соединения, принимающие участие в боевых действиях, готовились по двум программам в зависимости от условий их рода деятельности. Части, непосредственно участвовавшие в боевых действиях, проходили подготовку по семидневной программе. Другие, выведенные из боев на доукомплектование и пополнение боевых запасов, готовились по двадцатидневной программе.