Среди победоносных германских войск, маршировавших в те дни по территории «уродливого порождения версальской системы», Науйокса не было. Впрочем, он не бездействовал. Несколько недель спустя Гейдрих послал своего протеже в Чехословакию для совершения ряда диверсионных актов, с целью подорвать позиции чехословацкого правительства и создать условия для непосредственной нацистской оккупации. Науйокс и его люди взорвали несколько фабрик, возлагая ответственность за эти взрывы на недовольных рабочих. Продажный чешский режим разваливался на глазах, а его главари переметнулись на сторону нацистов.
Следующее задание Науйокса касалось противоборства с британской разведкой. За несколько месяцев до «Глейвицского инцидента» Гейдрих разработал план операции по проникновению в британские разведывательные службы. Он намеревался вовлечь двух высокопоставленных офицеров британской разведки, капитана Беста и майора Стивенса, в переговоры с якобы действующим немецким подпольем. По мысли Гейдриха, с помощью этого плана можно было бы узнать о британских разведывательных операциях в Германии.
Надо заметить, что у англичан действительно имелся план низложения Гитлера с помощью высокопоставленных немецких офицеров, не согласных с его политикой. Премьер-министр Великобритании Н. Чемберлен возлагал на него большие надежды, рассчитывая, таким образом, быстро закончить войну. Работа Беста и Стивенса занимала немаловажное место в осуществлении этих замыслов. Они должны были установить контакт с заговорщиками. При этом Бест был уполномочен предложить со стороны Англии следующие условия: если армия свергнет Гитлера, Англия признает территориальную целостность Германии в границах 1938 года и война, таким образом, будет остановлена.
20 октября 1939 года немецкий двойной агент организовал встречу Беста и Стивенса с мнимыми представителями главы германских заговорщиков в небольшой деревне в Голландии. На второй встрече, состоявшейся через 10 дней в Гааге, появился 29-летний Шелленберг, будущий начальник службы внешней разведки СД (VI управление РСХА). Шелленберг представился как майор Шеммель и заверил Беста и Стивенса в том, что вермахт готов совершить переворот и арестовать Гитлера. На следующей встрече он заявил, что лидеры заговора хотели бы напрямую поговорить с представителями английского правительства. Тогда англичане предложили забрать их самолетом из Венло, небольшого города в Голландии, расположенного на голландско-германской границе. Однако неожиданно обстоятельства резко изменились.
Дело в том, что вечером 8 ноября 1939 года, за день до встречи Шелленберга с британскими агентами, Гитлер присутствовал на встрече со своими старыми друзьями — соратниками по «пивному путчу» 1923 года в Мюнхене. Она проходила в пивной «Бюргербрау Келлер». Но в отличие от предыдущих подобных встреч Гитлер и остальные нацистские руководители ушли довольно рано. А спустя 11 минут после их ухода в пивной взорвалась бомба, убив 8 и ранив 62 человека.
Отвечавший за безопасность фюрера Гиммлер решил представить этот взрыв как покушение на жизнь Гитлера со стороны британской разведки. Спустя два дня при попытке пересечь швейцарскую границу был арестован столяр из Вюртемберга Эльзер, которого и обвинили в установке взрывного устройства в злосчастной пивной. Ошеломленный происшествием Гитлер поверил версии Гиммлера об «английском следе» и впал в неистовую ярость. Произнеся длинную обличительную речь против англичан, он приказал арестовать двух английских офицеров, с которыми Шелленберг должен был встречаться на следующий день.
9 ноября Шелленберг ожидал Беста и Стивенса в Венло в открытом кафе. Машина с агентами СД, которых возглавлял Науйокс, была припаркована неподалеку. Англичане приехали около половины четвертого вечера, но не одни, а вместе с офицером голландской разведки лейтенантом Клопом. Сразу после их прибытия агенты СД во главе с Науйоксом, беспорядочно стреляя в воздух, выскочили из засады. Это вызвало панику среди голландских пограничников, которые разбежались, даже не вытащив оружия. Однако в отличие от своих трусливых соотечественников Клоп выхватил пистолет и вступил в перестрелку с нападавшими, но был ранен Науйоксом. На этом перестрелка закончилась. Науйокс приказал своим людям схватить Беста, Стивенса и раненого Клопа, после чего все участники инцидента беспрепятственно уехали в Германию. Их отвезли в Дюссельдорф, где Клоп позднее скончался от ран, оказавшихся смертельными.
В гестапо захваченных англичан немедленно подвергли допросу. И хотя они так и не признались в причастности к организации мюнхенского взрыва, их отправили в концлагерь. Там они постепенно начали давать показания об агентурной сети МИ-6 в Европе и об агентах бельгийской и голландской разведок. Полученную от них информацию Гиммлер использовал в своих заявлениях, пытаясь оправдать вторжение Германии в эти страны в мае 1940 года. Бест и Стивенс оставались в плену до конца войны, пока в апреле 1945 года отряды союзников не обнаружили их в Нидердорфе, небольшом селе в Баварии.
Одновременно с операцией по захвату Стивенса и Беста Науйокс принял участие и в другой крупной антианглийской акции, поначалу известной как операция «Андреас». В сентябре 1939 года Гейдрих вызвал его к себе и поручил весьма «деликатное» дело. Он сообщил Науйоксу, что СД поручено организовать производство фальшивых денежных знаков иностранных государств. По его мнению, Науйокс обладал всеми необходимыми качествами, чтобы возглавить это дело.
Работа была выполнена с присущей немцам тщательностью и скрупулезностью. Маститые профессора университетов сделали анализы бумаги, на которой печаталась английская валюта. Ее изготовление также было поручено мастерам своего дела. Известные математики занимались расшифровкой системы, принятой английским казначейством для нумерации банкнотов. Семь месяцев подряд пять лучших граверов Германии работали над изготовлением матриц для печати. Однако успех пришел не сразу. Сотни опытов, проведенных в руководимой Науйоксом мастерской СД, закончились неудачей. И только весной 1941 года печатные станки наконец заработали.
В марте 1941 года один из агентов СД предъявил в швейцарском банке несколько фальшивых кредитных билетов и, сославшись на то, что приобрел их у лиц, связанных с черным рынком, попросил произвести экспертизу. Банковские служащие тщательно исследовали банкноты и единодушно признали их настоящими. Впрочем, самого Науйокса к тому времени давно уже перебросили на другую работу, и изготовлением фальшивой английской валюты под новым названием «Операция Бернгард» занимались уже другие люди.
В мае 1940 года, когда после 8 месяцев «странной войны» Гитлер неожиданно отдал приказ атаковать войска западных держав, Науйокс снова появился на границах, на этот раз во главе немецких командос, переодетых в форму бельгийских и голландских пограничников. Его люди проникали на вражескую территорию, захватывали стратегически важные мосты и удерживали их до подхода немецких войск.
Но уже в январе 1941 года Науйокса направляют в войска СС, так как он впал в немилость за то, что осмелился оспорить один из приказов Гейдриха. После нападения на СССР он оказался на Восточном фронте, где был ранен, о чем узнали в Берлине. В связи с тем, что существовала директива Гиммлера, запрещавшая посылать «носителей государственных тайн» в места, где они могли попасть в руки противника, было решено перебросить Науйокса в тихую и безопасную Бельгию. С сентября 1942 года он служил здесь в хозяйственном отделе военного управления. Но есть сведения, что его деятельность не ограничивалась работой на административном посту и что реальной задачей, поставленной перед Науйоксом, было уничтожение лидеров движения Сопротивления в Бельгии и Дании.
Когда всем стало очевидно грядущее поражение Германии, Науйокс совершил самый непонятный шаг в своей карьере. 19 октября 1944 года он перебежал к американцам. Впрочем, те быстро разобрались, с каким «антифашистом» им пришлось столкнуться. Науйокс был предан суду как военный преступник и в ожидании трибунала пытался спасти свою жизнь, предоставляя союзникам информацию о покойном Гейдрихе и операциях СД, по большей части носившую откровенно вымышленный характер. В этом ремесле Науйокс был не оригинален. Упоминавшийся ранее руководитель немецкой разведки Шелленберг тоже был не прочь подурачить легковерных англичан и американцев.
Однако, поняв, что скорее всего он будет приговорен к смерти, Науйокс в 1946 году совершил дерзкий побег из лагеря для военных преступников, и с тех пор его больше никто не видел. Есть сведения, что он поселился в Гамбурге, где через подставных лиц время от времени продавал в прессу материалы о бурной деятельности и многочисленных подвигах «человека, развязавшего Вторую мировую войну». В большинстве справочников в качестве даты смерти Науйокса указан 1960 год. По другим же сведениям, ветеран СД благополучно дожил до падения Берлинской стены, а возможно, жив и поныне.
