Во время управления домом Энрике орден Христа был в 1449 г. в очередной раз реформирован Жуаном, епископом Ла-мего. После смерти Энрике Навигатора, «комендантом» ордена Христа стал племянник и приемный сын Мореплавателя — принц Фернанду (сын короля Эдуарду I), умерший в 1470 г. В 1484 г. 11-м «комендантом» ордена Христа был назначен дом Мануэл ди Браганса, герцог Бежи, ставший через 11 лет, после смерти своего кузена и сводного брата короля Жуана (Иоанна) II (1481–1495), королем Португалии под именем Мануэла I (1495–1521).
Король Испании убедил папский престол передать орден Христа под «вечное управление» короля Португалии и его преемников. Дом Мануэл (Иммануил) I был окончательно признан Великим Магистром ордена Христа буллой папы римского Льва X «Constante fide» от 30 июля 1516 г. Однако его сын, король Жуан Ш, не получил эту должность автоматически, «по наследству», а был утвержден в качестве управляющего согласно бреве (кратким посланием) папы римского Адриана VI «Eximiae devotionis» от 14 апреля 1523 г. И лишь в 1551 г., после смерти принца Жоржи (Георгия), герцога Коимбры, внебрачного сына короля Жуана Ш, Магистра португальских рыцарских орденов Сан Бенто ди Авис и Св. Иакова, папа Юлиан III, в правление короля Португалии Жуана Ш, уступил навечно титул Великого Магистра всех рыцарских орденов Португалии, включая орден Христа, португальскому монарху. В результате объединения титула короля Португалии с должностью Великого Магистра ордена Христа произошло преображение этого ордена из магистерского (духовно-рыцарского) в коронный (династический). Некоторые историки считают, что именно это обстоятельство фактически привело к разделению ордена Христа на две ветви Воинства Господа нашего Иисуса Христа, папскую и португальскую, имеющие очень разные возможности и обязанности.
После того как орден Христа разделился на две ветви — португальскую и чисто папскую, — португальская ветвь постепенно утратила характер духовного (монашеского) ордена и стала династическим орденом португальской короны. Дело в том, что орден Христа, сыгравший в свое время столь заметную роль в военных успехах португальских королей в борьбе с пиренейскими маврами и заморскими мусульманами, со временем настолько усилился, что королевская власть была вынуждена принять меры к ограничению его самостоятельности и к началу XVI века добилась подчинения ордена непосредственно королю. После этого папа римский Александр VI Борджа освободил рыцарей Христа от монашеских обетов не-стяжания (бедности) и целомудрия (безбрачия), чем и подготовил окончательную секуляризацию ордена Христа (то есть превращение последнего в чисто светское учреждение), состоявшуюся в 1789 г., и конфискацию его владений в пользу государства, последовавшую в 1834 г.
В период подчинения Португалии испанской короне (1581–1610) правила приема в орден Христа (которому оказывал особое покровительство король Испании Филипп II Габсбург) были значительно упрощены. В него мог вступить любой дворянин (исп.: идальго, португ.: фидалгу), отбывший в течение двух лет военную службу в Африке или прослуживший три года на флоте.
Превратившись в династический орден португальской короны, он получил название Кородевский орден рыцарей Господа нашего Иисуса Христа (португ.: Real Ordem dos Cavaleiros des Nosso Senhor Jesus Christo).
В период существования Бразильской империи (императорами которой являлись отпрыски португальской королевской династии Браганса), с 1822 по 1890 г. существовал бразильский орден Христа, независимый от португальского.
После падения монархии в Португалии все королевские ордены (и ордена) были упразднены. Однако в 1917 г. по указу президента Португалии орден Христа был восстановлен (правда, в качестве чисто светской, гражданской награды).
Кавалером ордена Христа является, между прочим, дом Фернандо ди Соуза Фонтиш (Фонтес) — князь-регент и Великий Магистр возрожденного в 1808 г. международного ордена тамплиеров — Верховного Рыцарского (Воинского) ордена Иерусалимского Храма (лат.: Ordo Supremus Militaris Templi Hierosolymitani), штаб-квартира которого находится в португальском городе Порту (Порто).
После того как управление всеми рыцарскими орденами Португалии перешло в руки португальского короля, им была учреждена «Mesa da Consciencia е Ordens» (орденская согласительная палата) — организация, являвшаяся одновременно Высшим судом и Королевским органом управления с консультационным правом и обязанностью управления имуществом и делами рыцарских орденов. Это учреждение координировало и контролировало весь комплекс действий, связанных с приемом в рыцарские ордены и выдвижением кандидатур на мирские или духовные должности, запрашивая данные, касающиеся кандидата, его знатности, возраста, общественного положения, «чистоты крови» (к приему в орден не допускались лица с примесью иудейской или сарацинской крови) и пр., а также имела важную, хотя и не решающую, роль в предоставлении «dispensas» (льгот), то есть некоторые из условий принятия в орден могли быть обойдены королем Португалии или папой римским по просьбе кандидата. Процесс рассмотрения кандидатуры, в случае одобрения, заканчивался рекомендацией королю, как Великому Магистру, скреплявшему своей подписью соответствующие документы. Из вышесказанного видно, что папе римскому при приеме кандидата в орден Христа или назначении члена ордена на ту или иную орденскую должность отводилась незначительная роль согласования. С таким положением папский престол, естественно, никак не мог примириться.
Дело в том, что с давних времен папский престол претендовал на супрематию (верховную политическую власть) над всем Западным (католическим) миром, основывая свои претензии на документе, получившем название «Константинов дар», в котором первый христианский римский император Константин I Великий после переноса своей резиденции из Рима в Константинополь (Византий) якобы передал папе римскому Сильвестру и его преемникам императорскую власть над Римом, Италией и всем Западом. Еще в эпоху Ренессанса стало известно, что этот документ был сфабрикован и включен в сборники церковного права в середине VIII в., но в Средние века он считался подлинным и играл огромную роль в претензиях папства на верховную политическую власть. На протяжении веков папы римские считали светских государей своими подданными, но со времен правления французского короля Филиппа Красивого миф о неограниченном могуществе светской власти пап стал разваливаться. Тем не менее рыцарские ордены, несмотря на все изменения, произошедшие в них на протяжении XV и XVI вв., все еще должны были повиноваться римскому престолу Св. Петра, поскольку они продолжали находиться под папским руководством и управлением в духовной сфере, и папы римские всегда рассматривали себя как верховных глав этих воинских братств. Кроме того, святейший престол считал, что папа римский имеет полное право посвящать кого угодно в рыцари военного ордена, учрежденного на основании папской буллы. В 1581 г. португальский король вместе со своей армией погиб в борьбе с североафриканскими маврами, вследствие чего Португалия попала под власть Испании и полностью утратила свой суверенитет до 1610 г. В результате папы римские стали считать, что отныне орден
Христа подчиняется только им. Ватикан внес различные изменения в устав ордена Христа, что привело к образованию папской ветви ордена Христа, приобретшей при папе римском Григории XV (1621–1623) особый вес и престиж.
Первые исторические свидетельства о присуждении папами римскими тем или иным лицам (по собственному выбору, без всякого согласования с королями Португалии) Croce de Christo (Креста Христа) и соответственно о посвящении ими этих лиц в рыцари ордена Христа, датируются серединой XVI в. Согласно дому Жозе Висенти ди Браганса, «этот крест отличался от креста, который носили рыцари военного (португальского. — В.А.) ордена Христа, и вручался по папскому бреве как награда за службу Святейшему престолу. Путаница возникла в результате того, что некоторые чиновники департамента бреве в папском Риме начали оскорбительно и ошибочно включать выражение «Ordo cujus Magnus Magister est Rex Lusitaniae» («орден, Великий Магистр которого является королем Лузитании»; «Лузитания» — древнее, идущее еще со времен Античности, название Португалии) в текст папских бреве о награждении папскими Крестами Христа. Некоторые из лиц, награжденных папским Крестом Христа, убежденные, что их произвели в рыцари португальского воинства, начали носить знак португальского военного ордена Христа, вызывая тем самым путаницу между Крестом Христа и орденом Христа».
Практика самовольного посвящения папами римскими тех или иных лиц в рыцари ордена Христа (и награждения этих лиц Крестами Христа, не отличавшихся по внешнему виду от знаков принадлежности к португальскому ордену) возмущала португальских королей, и между папским престолом и португальской короной по этому поводу постоянно возникали конфликты. Но всякий раз, когда португальская корона протестовала против такой практики, папский престол ссылался на буллу 1319 г. об учреждении ордена Христа (несмотря на то, что в тексте этой буллы ровным счетом ничего не говорится о праве папы римского на посвящение кого-либо в рыцари ордена) или на какие-либо предыдущие соглашения, заключенные папским престолом с Португалией; но никаких документальных доказательств не было представлено ни разу. Временами спор по данному вопросу между Португалией и Ватиканом обострялся до предела. Так, например, в правление короля Жуана V (1706–1750) произошел поистине скандальный инцидент. Инцидент был вызван итальянским архитектором Джованни Сервандони, приглашенным в Португалию в 1745–1746 гг. для составления чертежей нового королевского дворца и женского монастыря Несессидадес в Лиссабоне. Архитектор уже был посвящен папой римским в рыцари ордена Христа и поэтому носил знак отличия ордена и в Лиссабоне, но король Жуан V, будучи Великим Магистром ордена Христа и считая, что обладает исключительным правом посвящать кого-либо в рыцари этого ордена, запретил Сервандони носить полученный тем от римского понтифика знак отличия (а когда тот не подчинился, приказал взять папского архитектора под стражу). Имели место и другие случаи заключения под стражу в Португалии кавалеров папского ордена Христа, осмеливавшихся открыто носить знаки принадлежности к этому ордену.
