В мае 1939 г. Разведупр стал 5-м управлением НКО и переведен на новый штат (341 военнослужащий и 189 вольнонаемных сотрудников) со сменой всех заместителей и начальников основных подразделений:
— заместитель начальника управления — майор А.В. Васильев (майор вместо корпусного (генерал-лейтенант) или дивизионного (генерал-майор) комиссара — явление, ставшее обычным для РККА с начала 1937 г., когда молодые и энергичные командиры среднего звена (их называли «дикорастущими») быстро делали карьеру, занимая генеральские должности);
— 1-й отдел — агентурная разведка на Западе (6 отделений), начальник майор (затем полковник) Ф.А. Феденко;
— 2-й отдел — агентурная разведка на Востоке (4 отделения), начальник майор (затем полковник А.П. Кисленко);
— 3-й отдел — военно-техническая разведка (6 отделений), начальник военный инженер 1-го ранга А.А. Коновалов;
— 4-й отдел — паспортный (2 отделения), начальник майор (затем полковник) С.Ф. Пивоваров (с июля 1939 г.);
— 5-й отдел — информационный (7 отделений), врид начальника полковник Г.П. Пугачев (с мая 1939 по июль 1940 г.); начальник генерал-майор Н.И. Дубинин — с декабря 1940 г. до января 1941 г., врид начальника полковник В.А. Новобранец — январь — апрель 1941 г., начальник генерал-майор Н.С. Дронов — с апреля 1941 г.; заместитель начальника отдела по Западу полковник Л.А Онянов, начальник немецкого отделения полковник Гусев, сотрудники немецкого отделения полковник Дьяков, майор Скрынников, майор Лукманов, капитан Горценштейн;
— 6-й отдел — приграничная разведка (3 отделения), начальник полковник Т.Ф. Корнеев;
— 7-й отдел — радиоразведка (2 отделения), начальник майор (затем полковник) Ф.П. Малышев;
— 8-й отдел — радиосвязь (4 отделения), начальник военный инженер 1-го ранга И.Н. Артемьев;
— 9-й отдел — шифровальный (4 отделения), начальник майор НА. Филатов (по октябрь 1939 г.), майор Л.С. Пелевин (с октября 1939 г.);
— 10-й отдел — внешних сношений, начальник полковник Г.П. Осетров;
— 11-й отдел — дешифровальный (7 отделений), начальник майор Н.А. Филатов (с октября 1939 г.):
• 1-е отделение — японское, начальник батальонный комиссар И. Калинин,
• 2-е отделение — китайское, начальник капитан Н. Аншуков,
• 3-є отделение — немецкое, начальник капитан Н. Охрименко,
• 4-е отделение — англо-романское, начальник военный техник 1-го ранга Ф. Огарышев,
• 5-е отделение — польско-прибалтийское, начальник капитан Ф. Охрименко,
• 6-е отделение — ближневосточное,
• 7-е отделение — учебное, начальник техник-интендант 1-го ранга Е. Шах;
— специальный отдел «А» — диверсионный (3 отделения), начальник Х.-У.Д. Мамсуров;
— политический отдел, начальник бригадный комиссар И.И. Ильичев;
— общий отдел (3 отделения), начальник майор (затем полковник) М.С. Маслов (с июня 1939 г.);
— отдел кадров (3 отделения), начальник полковник А. Кондратов, его заместитель — бригадный комиссар И.Ф. Туляков (с июня 1939 г.);
— административно-хозяйственный отдел, начальник майор (затем полковник) К.Н. Деревянко;
— отдел военной цензуры, начальник майор И. Пузырев;
— библиотека, начальник военный инженер 3-го ранга Г. Опрышко;
— Центральная школа подготовки командиров (начальников) штабов (должностные лица уровня округов и армий проходили курс обучения по управлению разведкой, в том числе и оперативной агентурной), начальник полковник М.А. Шалин (по июнь 1939 г.), майор П.С. Петров (с октября 1939 г.);
— Курсы усовершенствования комсостава, начальник полковник В.И. Швецов (по сентябрь 1939 г.), полковник Д.И. Гончаров (с сентября 1939 г.);
— НИИ по технике связи, начальник военный инженер 1-го ранга И.С. Кисиленко;
— Институт оперативной техники (16 военнослужащих, 21 вольнонаемный), начальник майор B.C. Четвериков (с декабря 1939 г.).
Прежний 9-й (Монголо-Синьцзянский) отдел стал самостоятельным подразделением Генштаба и получил наименование «отдел специальных заданий», начальник полковой комиссар Н.С. Соркин.
Особенностью этого штата стало создание впервые в центральном органе военной разведки за двадцатилетнюю историю его существования политического отдела. Этому событию предшествовало введение в июне 1938 г. должности помощника начальника управления по политической части.
Бывший сотрудник Разведупра В.А. Никольский вспоминает: «.На должности начальника управления и руководителей отделов приходили новые, преданные Родине командиры. Но они были абсолютно не подготовлены решать задачи, поставленные перед разведкой. В Центральном комитете партии считали, что в разведке, как, впрочем, и повсюду, самое главное пролетарское происхождение, все остальное может быть легко восполнено. Такие мелочи, как понимание государственной политики, уровень общей культуры, военная подготовка, знание иностранных языков, значения не имели. Это давало возможность проникать к руководству нашей «интеллигентной службой» случайным людям, ставящим корыстные, карьеристские интересы выше государственных, или просто добросовестным невеждам. Из них особенно отрицательно проявил себя И.И.
Ильичев (близкий родственник и протеже главного редактора газеты «Известия», а затем и «Правды» Л.Ф. Ильичева. — B.C.). Будучи начальником политического управления, он рассматривал как потенциальных «врагов народа» всех старых сотрудников разведки, а созданную ими агентурную сеть полностью враждебной и подлежащей поэтому уничтожению».
6 мая 1939 г. польский министр иностранных дел Юзеф Бек подписал в Лондоне соглашение о взаимных гарантиях между Великобританией и Польшей.
10 мая 1939 г. во время визита в Варшаву заместитель министра иностранных дел Советского Союза В.П. Потемкин в беседе с польским министром иностранных дел Ю. Беком заявил, что «СССР не отказал бы в помощи Польше, если бы она того пожелала».
11 мая 1939 г. в беседе с министром иностранных дел СССР польский посол В. Гжибовский, в соответствии с полученными из Варшавы инструкциями, высказал негативное отношение к вопросу о заключении пакта о взаимопомощи между Советским Союзом и Польшей.
19 мая 1939 г. в Париже был подписан совместный польско-французский протокол, предусматривающий как военную помощь, так и участие в боевых действиях Франции в случае германского нападения на Польшу.
В мае 1939 г. советское военное руководство, понимая, что в Европе пахнет порохом, разработало новую систему мобилизационного развертывания РККА, которое должно было осуществляться на базе 98 стрелковых дивизий. Предусматривалось иметь армию мирного времени численностью 2 265 000 человек. После мобилизации она должна насчитывать 6 503 500 человек, а количество дивизий возрасти до 170.
20 мая 1939 г. нарком обороны подписал директиву № 2/1/ 50698 от 20 мая 1939 г. Документ регламентировал порядок проведения скрытой мобилизации в стране под видом Больших учебных сборов (БУС).
Согласно пункту «Л» ст. 49 Конституции СССР, открытый вариант общей мобилизации всех Вооруженных сил Союза СССР должен был объявляться Указом Президиума Верховного Совета СССР. В этом случае призыв военнообязанных производится приказами народного комиссара обороны, расклеиваемыми для общего сведения (в порядке ст. 72–73 Закона о всеобщей воинской обязанности).
К 24 мая 1939 г. из Лондона в Варшаву поступают несколько донесений о группе «активистов» во главе с Черчиллем. Они требовали создания прочного англо-франкосоветского альянса, который бы положил конец территориальным претензиям со стороны Германии.
25 мая 1939 г. советский полпред в Польше П.П. Шаронов снова заявил в беседе с Ю. Беком, что СССР готов помочь, но, «чтобы помочь завтра, надо быть готовым сегодня, т. е. заранее знать о необходимости помогать». Польша советские предложения опять отвергает.
В мае 1939 г. опальный Л. Троцкий в своих произведениях высмеивает Сталина из-за его непонимания сути фашизма. Кроме того, изгнанник утверждает, что социал-демократия показала свое родство с фашистской идеологией, что советский вождь стал антисемитом, что Сталин находится в тайном сговоре с Гитлером и уже созрел для союза с Германией.
В период с июня 1937 по июль 1940 г. сменились четыре начальника и и. о. начальника Разведупра, и все они были арестованы и расстреляны:
— Берзин Я.К. - начальник с июня по август 1937 г., арестован 27 ноября 1937 г., расстрелян в этом же году;
— Гендин С.Г. - и. о. начальника с сентября 1937 по май 1938 г., арестован 22 октября 1938 г.;
— Орлов А.Г. - и. о. начальника с мая 1938 по апрель 1939 г., арестован 30 июня 1939 г.;
— Проскуров И.И. - начальник с апреля 1939 г. по июль 1940 г., в мае 1940 г. стал генерал-лейтенантом, арестован 27 июня 1941 г., расстрелян 28 октября 1941 г.
Репрессиям подверглась и верхушка ИНО. Последовательно были ликвидированы руководители политической разведки А. Артузов, А. Слуцкий, М. Шпигельглас.