Основными театрами военных действий в 1799 г. стали Египет, Италия, Южная Германия и Швейцария. Зная о подготовке двух мощных турецких армий – Дамасской и Родосской – Бонапарт предпринял в начале 1799 г. поход в Сирию. Здесь французам удалось неожиданно легко разгромить Дамасскую армию, однако длительная осада Акры завершилась неудачей. Вернувшись в Египет, Бонапарт сумел нанести поражение в битве при Абукире второй турецкой армии (25 июля 1799 г.). Вслед за этим Бонапарт отправился во Францию, оставив свою 30-тысячную армию в Египте еще на два года. Благодаря новости о победе под Абукиром он был встречен как национальный герой. Бонапарт стал главным действующим лицом в государственном перевороте 18 брюмера (9 ноября 1799 г.), в результате которого во Франции был установлен режим консулата.
На итальянском театре военных действий французы испытывали еще большие трудности. В феврале эскадре Ушакова, усиленной турецкими кораблями, удалось захватить Ионические острова. Развивая успех, союзный флот взял под контроль побережье Южной Италии. 3 июня был захвачен Неаполь. Дальнейшее наступление английского десантного корпуса при поддержке русских подразделений увенчалось капитуляцией Рима. С середины марта военные действия начались и в Северной Италии. Здесь австрийская армия фельдмаршала Меласа достаточно пассивно противостояла французской армии под командованием генерала Шерера. На помощь Шереру из Центральной Италии двигалась армия Макдональда. Ситуация резко изменилась после прибытия двух русских корпусов под командованием Суворова. В битве при Адде (26–28 апреля) Суворову удалось разгромить сменившего Шерера генерала Моро и обеспечить беспрепятственное вступление в Милан. Не давая двум французским армиям соединиться, Суворов быстрыми маневрами вынудил их вступить в сражение по одиночке. 17–19 июня в битве на реке Треббии была разгромлена армия Макдональда, а 15 августа в сражении при Нови поражение потерпел и преемник Моро генерал Жубер. Под контролем французов оставалась лишь Генуя. Цизальпийская республика была ликвидирована, Ломбардия вернулась в состав Австрии, а в Турине восстановилась власть Карла-Эммануила IV.
В Южной Германии австрийскому эрцгерцогу Карлу удалось разбить французскую армию генерала Журдана в битве при Штоках (25 марта). Вслед за этим, при поддержке русского корпуса Римского-Корсакова, австрийцы атаковали армию Массены в Швейцарии. Боевые действия здесь шли с переменным успехом. Французам даже удалось выиграть сражение под Цюрихом (4 июня), но в дальнейшем они были вынуждены отступить. 27 августа англо-русский десантный корпус под общим командованием герцога Йоркского высадился в Голландии. На сторону союзников перешел флот Батавской республики. Стремясь развить стратегический успех, австрийская армия эрцгерцога Карла двинулась из Швейцарии к Майнцу. Для поддержки корпуса Римского-Корсакова в Швейцарию должен был передислоцироваться Суворов. Это план не учитывал численное преобладание французов. Невероятный по своему драматизму переход суворовской армии через Альпы не принес результата. Еще до соединения русских войск Массене удалось разгромить корпус Римского-Корсакова. Дальнейшие бои в Швейцарии шли с переменным успехом и не имели большого значения. Не получили развития события и на голландском театре военных действий. В сражении под Бергеном англо-русские войска потерпели поражение и были вынуждены эвакуироваться в Англию (18 октября).
Таким образом, к началу 1800 г. стратегическая обстановка выровнялась, хотя Франция практически утратила все завоевания в Италии. Бонапарт, вступив в должность первого консула, демонстративно обратился к ведущим державам коалиции с предложением о мирных переговорах. Георг III и Франц II ответили отказом. Совершенно иначе прореагировал русский император. Павел I был разъярен «предательством» и «коварством» австрийцев. Захват же англичанами Мальты окончательно разрушил веру императора в союзников. Русским войскам было приказано возвращаться из Европы домой. Одновременно начались дипломатические контакты между Парижем и Петербургом. Бонапарт и Талейран хитроумно играли на чувствах экзальтированного русского монарха. Павлу были переданы знаки магистра Мальтийского ордена. Русские пленные во Франции были не только освобождены, но и получили новое вооружение и обмундирование. В личных письмах первый консул патетично призывал Павла I использовать все силы для установления в Европе прочного мира. Возник даже грандиозный план совместного похода в Индию. Однако гибель Павла I 11 марта 1801 г. не позволила заключить многообещающий русско-французский союз.
Весной 1800 г. положение французской армии Массены, осажденной в Генуе, стало критическим. В мае Бонапарт предпринял свой второй итальянский поход. Во главе 40-тысячной армии он неожиданным броском преодолел Альпы и отрезал путь отступления австрийцам от Генуи на юг. 4 июня Мессене пришлось таки капитулировать, но ситуацию это уже не изменило. 14 июня у селения Маренго Бонапарт разгромил превосходящие силы австрийцев и вынудил их подписать перемирие. Австрийская армия была отведена за реку Минчио, а Цизальпийская и Лигурийская республики восстановлены. Возобновление военных действий в конце 1800 г. не принесло австрийцам успеха. Была разгромлена и союзная им неаполитанская армия. Корпус генерала Мюрата совершил рейд до самого Неаполя. Одновременно рейнская армия Моро нанесла поражение австрийцам в сражении у Гогенлиндена (3 декабря 1800 г.). Южная Германия вновь оказалась под контролем французов, и Франц II признал свое поражение. 9 февраля был заключен Люневильский мирный договор, в соответствии с которым к Франции переходили левый берег Рейна, Бельгия и Люксембург, Австрия признавала все «дочерние» республики Франции, но сохраняла Истрию, Далмацию и Венецию. Для того, чтобы укрепить политическую стабильность в Италии, Бонапарт отказался от восстановления республик в Риме и Неаполе. Он признал светскую власть папы Пия VII, а также заключил выгодный мирный договор с неаполитанским королем Фердинандом IV. Но восстановления Савойской династии в Пьемонте Бонапарт не допустил (в сентябре 1802 г. Пьемонт был включен в составы Франции). Оставшись без союзников, Англия была вынуждена согласиться на примирение. Предварительные условия мира были подписаны уже 1 октября 1801 г.
Амьенский мирный договор между Францией, Англией, Испанией и Батавской республикой от 27 марта 1802 г. завершил эпопею революционных войн. Позднее к договору присоединилась и Турция. В соответствии с условиями Амьенского договора Англия возвращала Франции и ее союзникам все захваченные колонии (кроме голландского Цейлона и испанского Тринидада), а также должна была передать остров Мальту под контроль ордена Св. Иоанна Иерусалимского. Французские войска выводились из Рима, Неаполя и Египта. Владения Турции гарантировались в довоенных границах. При этом Англия не приняла обязательства признавать «естественные» границы Франции по Рейну и легитимность французских «дочерних» республик. Амьенский мир, который во Франции пропагандировался как «вечный», оказался лишь прологом к новой эпопее войн – наполеоновских.
Дипломатия и войны Первой империиЗаключение Амьенского мира лишь на короткое время снизило напряженность в международных отношениях. Франция упорно стремилась к роли континентального лидера, а Англия всеми силами противодействовала подобному развитию событий. Их новое военное столкновение было неизбежно. Прологом к нему стали активные внешнеполитические акции Франции в 1802–1803 гг. К ее территории были присоединены Пьемонт, Парма и остров Эльба. Франция выступила посредником во время гражданской войны в Швейцарии, что закончилось ликвидацией Гельветической республики, восстановлением Швейцарии как союза кантонов и провозглашением Бонапарта ее «медиатором». Под давлением Парижа в марте 1803 г. были упразднены 112 мелких германских княжеств – их территория отошла к Пруссии, Баварии, Бадену и Вюртембергу, из которых Париж пытался создать противовес Австрии. Со своей стороны и Англия, в нарушение своих обязательств, не торопилась с эвакуацией войск с Мальты. Развязка наступила в мае 1803 г., когда английский посол покинул Париж. Англо-французская война началась с массового захвата англичанами французских и голландских судов и грузов в самых различных портах Европы. Бонапарт ответил наложением эмбарго на торговлю с Англией и подготовкой десантной операции в военном лагере в Булони. В действительности, угроза для Британских островов была невелика, поскольку превосходство английского флота в Ла-Манше оставалось подавляющим. Дальнейшее развитие событий во многом зависело от положения на «дипломатическом фронте», где к этому времени появился еще один активный «игрок».